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ゲルろ過クロマトグラフィー（GFC）はサイズ排除クロマトグラフィー（SEC）の1つであり、水性溶媒を用いたSECをゲルろ過クロマトグラフィーと呼び、有機溶媒を用いたSECをゲル浸透クロマトグラフィー（GPC）と呼びます。
SECはカラム充填剤にポリスチレンゲルや親水性ポリマーなどの耐圧性多孔質粒子を用いて、その粒子の分子量の大きさによって分離が行われます。
そのため、ゲルの細孔より小さい物質は、ゲルの中に浸透しやすくなるため溶出が遅くなり、ゲルの細孔より大きな物質はゲルの中に浸透しにくいため、溶出が早くなります。
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ゲルろ過クロマトグラフィーでは保持容量（Ｖ）と試料分子の分子量（Ｍ）の対数に直線関係が成り立ちます。そのため、分子量がわかっている物質で検量線を作ることで、未知の物質の分子量をおおよそ推定することができます。
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ゲルろ過クロマトグラフィーは以下のカテゴリにあります。
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