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疎水性クロマトグラフィーとは、タンパク質とゲルに結合したリガンド間の疎水的相互作用を利用して分離するクロマトグラフィーのことです。
疎水性クロマトグラフィーには、疎水性部分−疎水性基間の結合を利用した吸着クロマトグラフィーと逆相系のような分配型クロマトグラフィーに分けられます。
疎水性基をもつゲルを充填させたカラムは、タンパク質や酵素の分離に適しています。タンパク質試料を親水性移動相で溶出すると、タンパク質表面の疎水性部分と担体上の疎水性基間の結合力の弱いものから流出します。（疎水相互作用クロマトグラフィー：HIC）
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疎水クロマトグラフィーのなかでも分配クロマトグラフィ型は、移動相が極性有機溶媒、固定相が長鎖の無極性リガンドで、両相間で溶質の分配が行われます。このタイプはHPLCでよく用いられます。
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疎水クロマトグラフィーは以下のカテゴリにあります。
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